Listede yaptığınız değişiklikleri nereye kaydetmek istiyorsunuz?
Bir metin dosyası mı bir veritabanına mı?

Kalıcı bir arşiv olmasını istersen bilgileri bir txt dosyasına veya bir veri tabanına yazdırmalısın. Yoksa programı kapattığın anda liste boşalır. Bu doğrultuda yazdığınız kodlarda biraz değişiklikler ve eklemeler yaptım.

#!/usr/bin/env python
#-*- coding:latin-1 -*-

from __future__ import division
import os
   


while True:
   liste = []
   dizin = os.listdir(os.getcwd())
   
   if "/forum/deC49FiC59Fiklik_kaydetme/arsiv.txt" in dizin:
	   oku=open("/forum/deC49FiC59Fiklik_kaydetme/arsiv.txt", "r").read() #eğer dosya varsa okuma kipinde açıyoruz
   else:
	   try:
	   	oku=open("/forum/deC49FiC59Fiklik_kaydetme/arsiv.txt", "w").read() #eğer dosya yoksa yeni bir dosya oluşturuyoruz
	   except IOError:
		oku=open("/forum/deC49FiC59Fiklik_kaydetme/arsiv.txt", "r").read()
   
   secenek1="1 - ARŞİVİ GÖR"
   secenek2="2 - ARŞİV'DE ARA"
   secenek3="3 - ARŞİV'E EKLE"
   secenek4="4 - ARŞİV'DEN ÇIKAR"
   secenek5="5 - ÇIKIŞ"
   
   print
   print
   print secenek1
   print secenek2
   print secenek3
   print secenek4
   print secenek5
   print
   
   soru = raw_input("Lütfen uygulamak istediğiniz adım numarasını seçin :")
   
   print
   
   liste1=oku.split() #arsiv.txt dosyamızın içeriğini listeye çeviriyoruz
   for i in liste1:
	   liste.append(i)
   
         
   
   if soru =="1":
      for i in liste:
	      i=i.replace("~~"," ") #liste öğelerimizi alt alta yazdırıyoruz
	      print "\n%s" %(i)
   
   
   if soru =="2":
      bul = raw_input("Lütfen aradığınız öğenin ismini girin :")
      for i in liste:
	      if bul in i:
		      i=i.replace("~~"," ")  #listede arama yapıyoruz 
		      print
		      print i
      
	      
	      
   
   def veri_gir(veri):
	   veri=veri.replace(" ", "~~") #eklemek istediğimiz öğeyi arsiv.txt dosyasına yazdırıyoruz.
	   yaz=open("/forum/deC49FiC59Fiklik_kaydetme/arsiv.txt", "a")
	   yaz.write(" %s" %(veri))
   
   def veri_cikar(veri):
	   liste.remove(veri)
	   liste1=" ".join(liste)
	   yaz=open("/forum/deC49FiC59Fiklik_kaydetme/arsiv.txt", "w")
	   yaz.write(liste1)
   
   if soru =="3":
      ekle = raw_input("Lütfen ekliyeceğiniz öğeyi yazın :")
      veri_gir(ekle)
      print
      print "Öğe başarıyla arşive eklendi."
      print
   if soru =="4":
      cikar = raw_input("Lütfen sileceğiniz öğeyi yazın :")
      cikar=cikar.replace(" ","~~")
      veri_cikar(cikar)
      print
      print "öğe başarıyla arşivden çıkarıldı."
      
   if soru =="5":
         break 

Üstteki kodları incelerseniz listeye eklenen öğeler bir text dosyasına yazdırılıyor ve programı kapatıp tekrar açtığınızda bile daha önce girmiş olduğunuz bilgilere ulaşabiliyorsunuz.
ayrıca arama özelliğini daha fonksiyoner hale getirdim.

yabancı olduğunuz kodları http://www.istihza.com adresinden okuyarak anlayabilirsiniz.
orjinal dosya ektedir.